Se estima que quedan menos de 2.000 ejemplares en estado silvestre
Científicos del CSIRO, la agencia científica nacional de Australia, han secuenciado el primer genoma completo del raro y esquivo pez mano moteado (Brachionichthys hirsutus), un pez marino en peligro crítico de extinción endémico de Tasmania.
Esta especie, que antes abundaba en la costa sureste de Tasmania, ha disminuido en número. En 1996, se convirtió en el primer pez marino catalogado como especie en peligro crítico de extinción.
Los científicos estiman que quedan menos de 2.000 ejemplares en estado silvestre.
La rápida disminución de la población del pez mano moteado se atribuye a prácticas pesqueras históricas, desarrollo costero, cambio climático y la llegada de especies invasoras.
El genoma es una herramienta fundamental para ayudar a conservar las especies, y fue necesario un esfuerzo coordinado, liderado por la Iniciativa de Genómica Aplicada (AGI) del CSIRO.
Imagen: Los científicos estiman que quedan menos de 2.000 ejemplares de pez mano moteado en estado salvaje. © Leah Soo, CSIRO
El Dr. Gunjan Pandey, investigador principal del CSIRO, dijo que la secuencia del genoma ayudará a los esfuerzos en curso para aumentar las cifras de población y monitorear la diversidad genética.
"El genoma nos ayuda a entender cómo funciona un organismo", afirmó el Dr. Pandey. "Proporciona una base para comprender la expresión genética en la vida diaria y ofrece información sobre su historia evolutiva. Con el genoma, podemos ayudar a detectar especies, monitorear poblaciones e incluso estimar la esperanza de vida de los peces".
La investigadora principal, Carlie Devine, que se especializa en la conservación y gestión del pez mano moteado, dijo que esta rica información genética ayudará a orientar la estrategia de conservación a largo plazo.
"Las medidas de conservación se están ampliando para incluir la genética, reconociendo que es esencial un enfoque multidisciplinario junto con la investigación ecológica para la conservación efectiva de las especies amenazadas", dijo Devine.
El Dr. Pandey dijo que la oportunidad de secuenciar el genoma del esquivo animal surgió cuando un pez mano moteado falleció en cautiverio por causas naturales.
Imagen: La secuenciación del genoma ayudará a los esfuerzos en curso para aumentar las cifras de población de pez mano moteado y monitorear la diversidad genética. © Tim Lynch
"Trabajar con especies marinas como el pez mano moteado es notoriamente difícil", dijo el Dr. Pandey. "El ADN se degrada rápidamente y se contamina con microorganismos. Esto hace que ensamblar un genoma puro sea extremadamente difícil".
El equipo logró secuenciar el genoma completo a partir de una pequeña cantidad de ADN de mala calidad, utilizando lo que se denomina un protocolo de bajo consumo de recursos. Esto se realizó en colaboración con el Centro de Recursos Biomoleculares de la Universidad Nacional de Australia.
"Somos uno de los tres únicos equipos a nivel mundial que utilizan este protocolo", afirmó el Dr. Pandey. "Personalizamos todo el proceso, desde la configuración del laboratorio hasta el software de bioinformática, para secuenciar un genoma de alta calidad a partir de ADN de mala calidad".
"Lo que antes nos llevaba de seis a doce meses, ahora lo podemos lograr en unos días. Esta tecnología es muy prometedora para comprender y conservar las especies en peligro de extinción en Australia y en todo el mundo".
Imagen: El enfoque multifacético de CSIRO para la conservación del pez mano moteado incluye un programa de cría en cautiverio. © Carlie Devine.
Los científicos de CSIRO han estado monitoreando al pez mano moteado desde 1997, vigilando nueve poblaciones localizadas dentro del estuario de Derwent.
El enfoque múltiple de CSIRO para conservar el pez mano moteado incluye un programa de cría en cautiverio, así como innovadores enfoques para la restauración del hábitat.
