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El mapa del microbioma de la Gran Barrera de Coral revela más de 500 nuevas especies bacterianas

botella de Niskin
Se instalaron dispositivos llamados botellas Niskin, suspendidos sobre el arrecife, para capturar microbios marinos en muestras de agua. (Crédito de la foto: Instituto Australiano de Ciencias Marinas)

Crean la Base de Datos de Genomas Microbianos de la Gran Barrera de Coral

En 2012 la revista Nature reveló que los seres humanos albergamos miles de diferentes especies de microbios en una serie de artículos que abrieron el camino para comprender el impacto del microbioma humano en nuestra salud.

Ahora, un artículo publicado en Nature documenta más de 800.000 genomas microbianos, identificando más de 500 nuevas especies bacterianas y más de 300.000 virus distintos en las aguas de la Gran Barrera de Coral.

Esta comunidad invisible fue documentada por un equipo de investigación liderado por la Universidad de Queensland y el Instituto Australiano de Ciencias Marinas (AIMS), utilizando ADN encontrado en muestras de agua de mar de 48 arrecifes.

Los autores creen que esta es la primera vez que se ha estudiado exhaustivamente el microbioma de los arrecifes de aguas abiertas de la Gran Barrera de Coral. Crearon la Base de Datos de Genomas Microbianos de la Gran Barrera de Coral, que está disponible para todos los investigadores de arrecifes.

"Ahora podemos empezar a explorar qué constituye un microbioma de arrecife saludable y cómo estas invisibles comunidades responden a los cambios en la Gran Barrera de Coral, como el blanqueamiento, las tormentas, los sedimentos, la pesca y otros factores de estrés", dijo el profesor Philip Hugenholtz, microbiólogo de la Universidad de Queensland y uno de los autores principales del artículo.

muestreo de agua de marImagen derecha: Muestreo de agua de mar en la Gran Barrera de Coral. Crédito: AIMS | Neal Cantin

Hace veinte años, era casi imposible identificar y documentar a los miembros de las vastas pero invisibles comunidades de microbios que viven en asociación con los seres humanos, las plantas y los animales, y que son esenciales para la vida en la Tierra.

El Dr. Yun Kit Yeoh es autor principal del artículo e investigador científico sénior en AIMS. Su trayectoria profesional en el estudio de los microbios lo ha llevado desde las plantas hasta los humanos y, actualmente, a los microbios de los arrecifes.

"Los avances en la secuenciación del ADN nos han permitido documentar y comenzar a modificar las comunidades de microbios que contribuyen, por ejemplo, a la salud de las plantas y a la salud humana. Los últimos avances nos han permitido estudiar los microbiomas en un ecosistema enorme, la Gran Barrera de Coral", afirmó Yeoh.

"Estos microbios son importantes. Las microalgas producen la mayor parte del oxígeno que respiramos y son la base de las cadenas alimentarias en los océanos abiertos", dijo Yeoh. "Son devorados por el krill y otros zooplancton, que a su vez son consumidos por otros animales, desde los pólipos de coral más pequeños hasta las ballenas más grandes. Pero hasta ahora, no habíamos podido observar estas comunidades".

Crassvirales marinosImagen derecha: Expansión de los Crassvirales marinos. Crédito: Nature (2026). DOI: 10.1038/s41586-026-10778-z.

El Dr. Steven Robbins, jefe de equipo en la Universidad de Queensland y primer autor del artículo, afirmó que es un desafío recolectar y secuenciar ADN microbiano en los océanos.

"Al océano le gusta mezclarlo todo", dijo. "Una sola gota de agua puede contener miles de microbios diferentes, pero a menudo muy emparentados entre sí; son comunidades realmente complejas. Muchos microbios marinos están adaptados a las condiciones de bajos nutrientes típicas de los ecosistemas oceánicos, lo que provoca que presenten bajos niveles de G y C, dos de las cuatro bases que forman la doble hélice del ADN. Es precisamente la combinación de esos bajos niveles de GC y la complejidad de las comunidades lo que ha dificultado este tipo de investigación".

"En este estudio, utilizamos nuevas tecnologías de secuenciación de lectura larga que evitan estos problemas y facilitan enormemente el ensamblaje del genoma de cada microbio. Lo que antes era un rompecabezas con decenas de miles de piezas se convierte en un sencillo rompecabezas con muchas menos piezas para el genoma microbiano promedio".

Entre los descubrimientos más destacados del equipo se incluyen:

• La identificación de 5283 genomas bacterianos y arqueales diferentes, que representan 876 especies distintas, dos tercios de las cuales son nuevas en las bases de datos públicas y están disponibles para su estudio por primera vez.

• Se identificaron 362.802 tipos diferentes de virus, incluidos los Crassvirales, virus que infectan bacterias y que se encontraron por primera vez en el intestino humano en 2014. Inicialmente se pensó que eran posibles indicadores de la presencia de desechos humanos o animales pero, como muestra este estudio, también se encuentran en las aguas oceánicas abiertas del arrecife.

• La recuperación de cromosomas completos de Bathycoccus y Ostreococcus directamente del agua de mar, las dos microalgas más abundantes en el arrecife.

"Este estudio complementará el seguimiento a largo plazo de la Gran Barrera de Coral, que AIMS lleva a cabo desde hace más de 40 años", dijo Yeoh.

El artículo científico se ha publicado en Nature: The planktonic microbiome of the Great Barrier Reef

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